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Packagerki.demis.r4.core
Resource TypeStructureDefinition
IdStructureDefinition-PathogenDetection.json
FHIR VersionR4
Sourcehttps://simplifier.net/resolve?scope=rki.demis.r4.core@1.23.2&canonical=https://demis.rki.de/fhir/StructureDefinition/PathogenDetection
URLhttps://demis.rki.de/fhir/StructureDefinition/PathogenDetection
Version1.2.0
Statusactive
Date2023-05-05
NamePathogenDetection
TitleErregernachweis
DescriptionDer Erregernachweis enthält die Angaben zum durchgeführten Labortest, zur Nachweismethode und zur verwendeten Probe.
TypeObservation
Kindresource

Resources that use this resource

StructureDefinition
rki.demis.r4.core#1.23.2LaboratoryReportLaborbericht
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionABVPErregernachweis für Arboviren (sonstige)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionACBPErregernachweis für Acinetobacter spp. bei Nachweis einer Carbapenemase-Determinante oder mit verminderter Empfindlichkeit gegenüber Carbapenemen außer bei natürlicher Resistenz; Meldepflicht nur bei Infektion oder Kolonisation.
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionADEPErregernachweis für Adenoviren; Meldepflicht bei akuter Infektion für Nachweise aus allen Körpermaterialien
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionADVPErregernachweis für Adenoviren; Meldepflicht nur für den direkten Nachweis im Konjunktivalabstrich
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionASTPErregernachweis für Astroviren
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionBANPErregernachweis für Bacillus anthracis
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionBOBPErregernachweis für (Lyme-) Borreliose, Borrelia burgdorferi
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionBORPErregernachweis für Borrelia recurrentis
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionBOVPErregernachweis für humanpathogene Bornaviren; Meldepflicht nur für den direkten Nachweis
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionBPSPErregernachweis für Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionBRUPErregernachweis für Brucella sp.
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCAMPErregernachweis für Campylobacter spp. (darmpathogen)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCAUPErregernachweis für Candida auris; Meldepflicht nur für den direkten Nachweis
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCHLPErregernachweis für Chlamydia psittaci
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCKVPErregernachweis für Chikungunya-Virus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCLOPErregernachweis für Clostridium botulinum oder Toxinnachweis
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCLTPErregernachweis für Tetanus, Clostridium tetani
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCORPErregernachweis für Corynebacterium spp. (Toxin bildend)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCOXPErregernachweis für Coxiella burnetii
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCRYPErregernachweis für humanpathogene Cryptosporidium sp.
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCVDPErregernachweis für Severe-Acute-Respiratory-Syndrome-Coronavirus-2 (SARS-CoV-2)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCVSPErregernachweis für Severe-Acute-Respiratory-Syndrome-Coronavirus (SARS-CoV)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionCYMPErregernachweis für Cytomegalie, Cytomegalievirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionDENPErregernachweis für Denguevirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionEAHPErregernachweis für Amoebiasis, Entamoeba histolytica
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionEBCPErregernachweis für Enterobacterales bei Nachweis einer Carbapenemase-Determinante oder mit verminderter Empfindlichkeit gegenüber Carbapenemen außer bei natürlicher Resistenz; Meldepflicht nur bei Infektion oder Kolonisation
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionEBVPErregernachweis für Ebolavirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionECOPErregernachweis für Escherichia coli (sonstige darmpathogene Stämme)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionEHCPErregernachweis für Escherichia coli (enterohämorrhagische Stämme) (EHEC)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionETVPErregernachweis für Enteroviren
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionFRTPErregernachweis für Francisella tularensis
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionFSVPErregernachweis für FSME-Virus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionGBSPErregernachweis für Gruppe-B-Streptokokken (GBS); Meldepflicht nur für den direkten Nachweis bei Schwangeren und Neugeborenen
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionGFVPErregernachweis für Gelbfiebervirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionGILPErregernachweis für Giardia lamblia
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionHAVPErregernachweis für Hepatitis-A-Virus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionHBVPErregernachweis für Hepatitis-B-Virus; Meldepflicht für alle Nachweise
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionHCVPErregernachweis für Hepatitis-C-Virus; Meldepflicht für alle Nachweise
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionHDVPErregernachweis für Hepatitis-D-Virus; Meldepflicht für alle Nachweise
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionHEVPErregernachweis für Hepatitis-E-Virus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionHFAPErregernachweis für andere Erreger hämorrhagischer Fieber
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionHFMPErregernachweis für Hand-Fuß-Mund-Krankheit
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionHINPErregernachweis für Haemophilus influenzae; Meldepflicht nur für den direkten Nachweis aus Liquor oder Blut
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionHTVPErregernachweis für Hantavirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionINVPErregernachweis für Influenzavirus; Meldepflicht nur für den direkten Nachweis
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionLEGPErregernachweis für Legionella sp.
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionLEPPErregernachweis für humanpathogene Leptospira sp.
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionLISPErregernachweis für Listeria monocytogenes; Meldepflicht nur für den direkten Nachweis aus Blut, Liquor oder anderen normalerweise sterilen Substraten sowie aus Abstrichen von Neugeborenen
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionLSVPErregernachweis für Lassavirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionMBVPErregernachweis für Marburgvirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionMPMPErregernachweis für Mycoplasmen
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionMPVPErregernachweis für Mumpsvirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionMPXPErregernachweis für Mpoxvirus (Orthopockenviren)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionMRAPErregernachweis für Staphylococcus aureus (Methicillin-resistente Stämme); Meldepflicht nur für den Nachweis aus Blut oder Liquor
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionMRSPErregernachweis für Middle-East-Respiratory-Syndrome-Coronavirus (MERS-CoV)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionMSVPErregernachweis für Masernvirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionMYLPErregernachweis für Mycobacterium leprae
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionMYTPErregernachweis für Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium africanum, Mycobacterium bovis; Meldepflicht für den direkten Erregernachweis sowie nachfolgend für das Ergebnis der Resistenzbestimmung; vorab auch für den Nachweis säurefester Stäbchen im Sputum
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionNEIPErregernachweis für Neisseria meningitidis; Meldepflicht nur für den direkten Nachweis aus Liquor, Blut, hämorrhagischen Hautinfiltraten oder anderen normalerweise sterilen Substraten
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionNOVPErregernachweis für Norovirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionOPXPErregernachweis für Orthopockenviren (sonstige Orthopockenviren)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionPINPErregernachweis für Parainfluenzavirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionPKVPErregernachweis für Orthopockenviren (Variolavirus)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionPLAPErregernachweis für Plasmodium spp. (Malaria)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionPOVPErregernachweis für Poliovirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionPVBPErregernachweis für Ringelröteln, Parvovirus B 19
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionRBVPErregernachweis für Rabiesvirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionRICPErregernachweis für Rickettsia prowazekii
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionRSVPErregernachweis für Respiratorisches-Synzytial-Virus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionRTVPErregernachweis für Rotavirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionRUVPErregernachweis für Rubellavirus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionSALPErregernachweis für Salmonella (sonstige)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionSHIPErregernachweis für Shigella sp.
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionSPAPErregernachweis für Salmonella Paratyphi; Meldepflicht für alle direkten Nachweise
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionSPNPErregernachweis für Streptococcus pneumoniae; Meldepflicht nur für den direkten Nachweis aus Liquor, Blut, Gelenkpunktat oder anderen normalerweise sterilen Substraten
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionSPYPErregernachweis für Scharlach, Beta-hämolysierenden Streptokokken der Gruppe A
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionSTYPErregernachweis für Salmonella Typhi; Meldepflicht für alle direkten Nachweise
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionTRIPErregernachweis für Trichinella spiralis
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionVCHPErregernachweis für Vibrio spp. (humanpathogen); soweit ausschließlich eine Ohrinfektion vorliegt nur bei Vibrio cholerae
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionVZVPErregernachweis für Varizella-Zoster-Virus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionWBKPErregernachweis für Krankheitserreger unter Berücksichtigung der Art der Krankheitserreger und der Häufigkeit ihres Nachweises wenn Hinweise auf eine schwerwiegende Gefahr für die Allgemeinheit bestehen
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionWNVPErregernachweis für West-Nil-Virus
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionYENPErregernachweis für Yersinia spp. (darmpathogen)
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionYPSPErregernachweis für Yersinia pestis
rki.demis.r4.core#1.23.2PathogenDetectionZKVPErregernachweis für Zika-Virus
rki.demis.igs#5.0.0PathogenDetectionSequenceSequenz-Erregernachweis
rki.demis.laboratory.strict#5.0.0-rc.1LaboratoryReportNonNominalNichtnamentlicher Laborbericht für nichtnamentliche oder anonyme Erregernachweismeldungen nach § 7 Abs. 3 IfSG
rki.demis.laboratory.strict#5.0.0-rc.1PathogenDetectionCHTPErregernachweis für Chlamydia trachomatis, sofern es sich um einen der Serotypen L1 bis L3 handelt
rki.demis.laboratory.strict#5.0.0-rc.1PathogenDetectionECHPErregernachweis für Echinococcus sp.
rki.demis.laboratory.strict#5.0.0-rc.1PathogenDetectionHIVPErregernachweis für Humanes Immundefizienz-Virus (HIV)
rki.demis.laboratory.strict#5.0.0-rc.1PathogenDetectionNCVPErregernachweis für Vibrio spp., humanpathogen (außer Erreger der Cholera); soweit ausschließlich eine Ohrinfektion vorliegt, nur bei Vibrio cholerae non O1/non-O139
rki.demis.laboratory.strict#5.0.0-rc.1PathogenDetectionNEGPErregernachweis für Neisseria gonorrhoeae
rki.demis.laboratory.strict#5.0.0-rc.1PathogenDetectionTOXPErregernachweis für Toxoplasma gondii; Meldepflicht nur bei konnatalen Infektionen
rki.demis.laboratory.strict#5.0.0-rc.1PathogenDetectionTRPPErregernachweis für Treponema pallidum

Resources that this resource uses

StructureDefinition
rki.demis.common#3.0.0-rc.6NotifiedPersonBetroffene Person
rki.demis.r4.core#1.23.2SpecimenProbe
ValueSet
rki.demis.r4.core#1.23.2laboratoryTestLabortest
rki.demis.r4.core#1.23.2methodNachweismethode
rki.demis.r4.core#1.23.2pathogenDetectionStatusErregernachweis-Status

Narrative

No narrative content found in resource


Source1

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  "id": "PathogenDetection",
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  "name": "PathogenDetection",
  "title": "Erregernachweis",
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  "description": "Der Erregernachweis enthält die Angaben zum durchgeführten Labortest, zur Nachweismethode und zur verwendeten Probe.",
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        "definition": "Typ des durchgeführten Labortests. Der Wert muss als LOINC-Code - entsprechend des vom RKI definierten und in regelmäßigen Abständen aktualisierten ValueSets (https://demis.rki.de/fhir/ValueSet/laboratoryTest) – im coding Element dargestellt werden. Für eine begrenzte Übergangszeit ist die Verwendung des text Elementes in Ausnahmefällen zulässig. Folgende Ausbaustufen des Systems werden hier jedoch deutlich restriktiver sein, um einen automatisierte Weiterverarbeitung der Inhalte im Gesundheitsamt zu ermöglichen.",
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            "key": "codingOrText",
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        "path": "Observation.code.coding.code",
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        "path": "Observation.subject",
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        "definition": "Verweis auf die in der Meldung benannte betroffene Person. Hierbei handelt es sich grundsätzlich um den Verweis auf die in der Erregernachweismeldung als „subject“ referenzierte Patient Ressource.",
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        "path": "Observation.subject.reference",
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        "path": "Observation.performer",
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        "path": "Observation.value[x]",
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        "definition": "Ergebnis des durchgeführten Labortests. Für qualitative Tests muss valueCodableConcept mit einem Code aus der AnswerList genutzt werden. Wir verweisen dazu in erster Linie auf die hinterlegte Answercodeliste im Implementierungsleitfaden (https://simplifier.net/guide/ImplementierungsleitfadenfrDEMIS/AnswerSet?version=current) oder auf die für den jeweiligen Labortestest auf loinc.org hinterlegten Answer-Codes. Für quantitative Tests muss valueQuantity genutzt werden. Siehe auch https://wiki.gematik.de/display/DSKB/Implementierungshinweise+zur+Labormeldung. Für eine begrenzte Übergangszeit ist die Verwendung von valueString in Ausnahmefällen zulässig. Folgende Ausbaustufen des Systems werden hier jedoch deutlich restriktiver sein, um einen automatisierte Weiterverarbeitung der Inhalte im Gesundheitsamt zu ermöglichen.",
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            "code": "string"
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        "path": "Observation.dataAbsentReason",
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        "path": "Observation.interpretation",
        "short": "Interpretation des Testergebnisses",
        "definition": "Interpretation des Testergebnisses. Mindestens eine vollständig kodierte Interpretation des Testergebnisses, die Auskunft über die Bewertung in Bezug auf die Festlegung der Meldetatbestände gemäß IfSG gibt, muss angegeben werden. Relevante Codes sind POS für positive direkte oder indirekte Erregernachweise, NEG für negative und IND für unbestimmte Ergebnisse.",
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      },
      {
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        "path": "Observation.interpretation.coding.system",
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      {
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        "path": "Observation.note",
        "short": "Textuelle Hinweise zum Untersuchungsergebnis.",
        "definition": "Textuelle Hinweise zum Untersuchungsergebnis, die dem Gesundheitsamt eine bessere Bewertung der Ergebnisse ermöglichen.",
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      },
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        "short": "Angaben zur genutzten Nachweismethode.",
        "definition": "Angaben zur genutzten Nachweismethode. Über die im Observation.code verschlüsselte Nachweismethode hinaus, sollen dem öffentlichen Gesundheitsdienst detaillierte Angaben zur jeweils genutzten Nachweismethode bereitgestellt werden. Sofern verfügbar, ist einer der durch das RKI definierten Codes aus dem referenzierten ValueSet zu verwenden.",
        "comment": "Die Angabe der Nachweismethode unter Verwendung von method.text ist in folgenden zwei Ausnahmefällen zulässig: \r\n- Die Nachweismethode ist in dem ValueSet https://demis.rki.de/fhir/ValueSet/method nicht enthalten. Bitte geben Sie Feedback an die DEMIS Geschäftsstelle (demis@rki.de), damit das ValueSet ergänzt werden kann.\n- Das Primärsystem kann die internen Codes zur Zeit noch nicht korrekt auf die SNOMED-Codes des ValueSets https://demis.rki.de/fhir/ValueSet/method mappen.",
        "constraint": [
          {
            "key": "codingOrText",
            "severity": "error",
            "human": "Entweder coding oder text muss angegeben sein.",
            "expression": "coding.empty() or text.empty()",
            "source": "http://hl7.org/fhir/StructureDefinition/Observation"
          }
        ],
        "mustSupport": true
      },
      {
        "id": "Observation.method.coding",
        "path": "Observation.method.coding",
        "max": "1",
        "binding": {
          "strength": "extensible",
          "valueSet": "https://demis.rki.de/fhir/ValueSet/method"
        }
      },
      {
        "id": "Observation.method.coding.system",
        "path": "Observation.method.coding.system",
        "min": 1
      },
      {
        "id": "Observation.method.coding.code",
        "path": "Observation.method.coding.code",
        "min": 1
      },
      {
        "id": "Observation.specimen",
        "path": "Observation.specimen",
        "short": "Verweis auf die dem Labortest zugrundeliegende Probe.",
        "definition": "Verweis auf die dem Labortest zugrundeliegende Probe. Über die Probe können Angaben zum verwendeten Material und deren Einsender gemacht werden.",
        "min": 1,
        "type": [
          {
            "code": "Reference",
            "targetProfile": [
              "https://demis.rki.de/fhir/StructureDefinition/Specimen"
            ],
            "aggregation": [
              "bundled"
            ]
          }
        ],
        "mustSupport": true
      },
      {
        "id": "Observation.device",
        "path": "Observation.device",
        "max": "0"
      },
      {
        "id": "Observation.referenceRange",
        "path": "Observation.referenceRange",
        "max": "0"
      },
      {
        "id": "Observation.hasMember",
        "path": "Observation.hasMember",
        "max": "0"
      },
      {
        "id": "Observation.derivedFrom",
        "path": "Observation.derivedFrom",
        "max": "0"
      },
      {
        "id": "Observation.component",
        "path": "Observation.component",
        "max": "0"
      }
    ]
  }
}